基于转录组学和蛋白质组学的高海拔左心室高压大鼠模型的新靶点

大肠动脉高拉出（PH）是指静息时少于大肠动脉拉出≥25 mmHg。 它根据脏器动力讲授特征、发作选择性和病理讲授包含五类。 第三类荒漠大肠动脉高拉出（HAPH）是由于在荒漠肺部生态系统中都大肠通气生产量代偿性增高和大肠小动脉外周惹来的，随之而来山地区心肌病。 临床症状有数运动性呼吸困难、痉挛和疲劳。 HAPH 可能反映了并未适应荒漠，并伴有不清楚的病理生理选择性。 大约有 1.4 亿人生活在海拔 2,500 米以上的东部，每年有超过 4,000 万人访问期间这些荒漠东部。 肺部随之而来脑部等位基因强调谱时有发生差异波动； 这在在一直居住在荒漠东部的村民及其祖先的等位基因型灵活性波动中都得知的。HAPH 的病人仍在数据统计分析中都。应建议患者移至低海拔东部，氧疗直接。药品病人的数据统计分析仅限于一些随机试验。 HAPH 的病理与其他子类的 PH 相互似，因此值得考虑对 PAH 直接的药品是否对 HAPH 直接。

然而，所有这些类似物药品都在HAPH中都的直接性和选择性尚不清楚。为了解决这个缺陷，我们旨在数据统计分析肺部所限于的原子选择性，用作鼠类 HAPH 静态，并运用于综合多三组讲授方法。 在此现实生活中都，我们旨在数据统计分析几种类似物药品和复氧的起着，以确定荒漠惹来的肺部的潜在新的病人靶点。 尤其是，我们数据统计分析了类似物药品如何影响脑部二者之间的差异等位基因和氨基酸强调。

数据统计分析设计：

将鼠类置于 10% O2（肺部）室中都 3 周以产生 PH。对照鼠类（C 三组）在整个实验中都都处于常氧生态系统下，并在病人期间（即从第 21 天开始）用多种形式完成病人。 3周时，其余鼠类随机包含六三组；一三组被斩首（第 21 天）以评估心大肠特性。其余 5 三组用类似物药品或复氧病人，从第 21 天到第 35 天斩首。慢性肺部，多种形式处置（M）；慢性肺部，司来帕格病人；慢性肺部，诺瓦替坦病人；慢性肺部，riociguat 病人；慢性肺部、复氧 (RE)。

磷酸化三组统计分析：

所含总 RNA，并通过用作 Arraystar rRNA Removal Kit 去除 rRNA 来富含 mRNA 和非编码 RNA。 mRNA 和非编码 RNA 被片段化缓冲液分解短片段（~200-500 nt）。以短片段为模板，并用随机六聚体引物合成第一双链cDNA。在第二双链合成现实生活中都，dTTP 被 dUTP 取代。 然后加入洗脱缓冲液以通过末端修复和附加腺嘌呤来化讲授合成和分离短片段。 短片段被化讲授合成并与接头连接； 用作尿嘧啶-N-糖基化酶消化第二条双链。 琼脂糖胶体后，选择合适的片段作为模板完成PCR缩减到。 用作 Agilent 2100 微生物统计分析仪和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 系统对探头库完成统计分析方法和质生产量评估。 该文库用作 Illumina HiSeq 2000 系统完成核酸。

LC-MS/MS 统计分析

在连接到 Easy-nLC 1000 液相互色谱系统的Q Exactive HF 气相互上统计分析探头。将潮湿的肽探头重新的溶解在组分 A（0.1% 硫酸水溶液）中都并存储到捕集柱中都用作组分 A 的最主要拉出力为 280 bar，然后在；也的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的梯度完成分离移动相互 B（乙腈和 0.1% 硫酸），水流生产量为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 统计分析是在 3e6 离子的自动增益控制目标下完成一次全扫描，然后完成有约 30 次与数据相互关的 MS/MS 扫描较强更高光能的碰撞解离，在 Orbitrap 中都检测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

数据统计分析结果：

基于RNA-seq数据的共强调网络的特性富含统计分析和交通中心原子鉴定。

基于氨基酸数据的共强调网络的特性富含统计分析和交通中心原子鉴定。

RNA-seq 和氨基酸三组讲授概述了对三种药品的反应二者之间的强一致性，较强几乎相互同的效果。GO 富含显示差异强调的等位基因有数参与代谢调节、磷酸化和翻译的等位基因。

司来帕格、诺瓦替坦和复氧可增高 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被鉴定出来，通过多三组讲授筛选，作为参与HAPH的关键等位基因。这些发现为 HAPH 的类似物药品选择性共享了新的的见解。

数据统计分析论断：

Selexipag、macitentan 和复氧显着减弱了鼠类 HAPH 静态，而 riociguat 的起着较弱。 差异强调的等位基因参与代谢管控、磷酸化和翻译。 某些氨基酸受到 HAPH 和病人的影响。 我们用作多三组讲授方法筛选了关键等位基因 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些发现可能有助更容易地了解肺部所限于的原子选择性，并可能共享新的的病人靶点。

古书出处：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.